Los Angeles, 1947: Bei einem mysteriösen Mordfall erhält SSR-Chief Sousa Verstärkung von Peggy Carter. Die Spur führt zur Firma Isodyne, die das Manhatten-Projekt replizieren wollte und so die mysteriöse Energiequelle Zero Matter entdeckt hat, für die sich auch eine mysteriöse Gegnerin interessiert.